Η Φυσική Αγωγή αφορά στις κινητικές ικανότητες (φυσική) και στη διαπαιδαγώγηση (αγωγή) των μαθητών. Σκοπός του μαθήματος της Φυσικής Αγωγής στο δημοτικό είναι τα παιδιά:

Επιπλέον στόχος είναι να ανακαλύψουν τα παιδιά το άθλημα που τους ταιριάζει, ώστε να στραφούν στον εξωσχολικό αθλητισμό και τη διά βίου άθληση.

Διεξάγονται ενδοτμηματικά πρωταθλήματα ποδοσφαίρου και μπάσκετ, γίνονται αγώνες μεταξύ των τμημάτων και αγώνες στίβου. Στο τέλος, οι μαθητές της Στ' μετά από μυστική ψηφοφορία βραβεύουν τον καλύτερο παίκτη και τον πρώτο σκόρερ.

Στην αρχή της σχολικής χρονιάς γίνονται σωματομετρήσεις (ύψος, βάρος, κυρτώματα σπονδυλικής στήλης, γόνατα) και τεστ φυσικής κατάστασης (δύναμη, ταχύτητα, αντοχή, ευλυγισία, επιδεξιότητα). Κάθε παιδί έχει το δικό του ατομικό δελτίο με συγκεκριμένες παρατηρήσεις και προσωπικό στόχο. Στο τέλος της σχολικής χρονιάς ξαναγίνονται οι ίδιες μετρήσεις και τα ίδια τεστ, ώστε να δούμε τη βελτίωση του κάθε μαθητή μέσα από την ομαδική δουλειά στο σχολείο, αλλά και την ατομική προσπάθεια εξωσχολικά (προσεγμένη διατροφή, περισσότερη προπόνηση).